Σύμφωνα με την παράδοση ο πρώτος οικιστής του χωριού είχε έρθει από την Μαρώνεια στη Θράκη. Το χωριό αναφέρεται από τον Φραντσέσκο Μπαρότσι το 1577 ως Marones στην επαρχία Σητείας. 

Στην ενετική απογραφή του 1583 από τον Καστροφύλακα αναφέρεται ως Marunea με 96 κατοίκους. Σε συμβόλαιο του 1591 αναφέρεται ως Μαρουνέα. Ο Βασιλικάτα το αναφέρει το 1630 ως Marunea. Στην τουρκική απογραφή του 1671 αναφέρεται ως Maruta με 9 χαράτσα.

Το χωριό αναφέρεται στην αιγυπτιακή απογραφή του 1834 ως Maronia με 8 χριστιανικές οικογένειες. Το 1881 αναφέρεται ως Μαρωνιά με 165 κατοίκους, όλοι χριστιανοί, και ανήκε στο δήμο Λιμένος Σητείας